Uns ist es gelungen, weltweit die ersten kompletten Genomsequenzen des Chloroplasten und des Mitochondriums von Populus tremula (Europäische Zitterpappel) aus Sequenzdaten der nächsten Generation zusammenzubauen. Die große Genomsequenz des Mitochondriums von Populus tremula (fast 800 000 bp) ist weltweit die erste komplette mitochondriale Sequenz innerhalb der Familie der Salicaceae, wozu neben Populus auch die Weide (Salix) gehört. Damit haben wir wichtige Ressourcen für die Pappelzüchtung geschaffen. Wir konnten allein durch den Vergleich der gesamten Chloroplastensequenzen von zwei Zitterpappeln mit anderen verfügbaren Pappel-Chloroplastensequenzen DNA-Variationen (SNPs) in der Zitterpappelsequenz finden, die es erlauben, die Zitterpappel von den anderen Pappelarten zu unterscheiden. Diese SNPs wurden wie ein Barcode auf der kompletten Chloroplastensequenz der Zitterpappel dargestellt. Die weitere experimentelle Analyse von drei dieser SNPs lieferte die Bestätigung, dass diese SNPs wirklich in der Lage sind, Zitterpappeln von den anderen untersuchten Pappeln zu unterscheiden.

Weitere Informationen: http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0147209