Das Institut für Forstgenetik des Johann Heinrich von Thünen-Instituts, Bundesforschungsinstitut für Ländliche Räume, Wald und Fischerei, sucht am Standort Großhansdorf im Arbeitsbereich „Genomforschung“ zum nächstmöglichen Zeitpunkt befristet für die Laufzeit von 36 Monaten eine*n

wissenschaftliche*n Mitarbeiter*in / PostDoc (w/m/d)

(Biologie, Forstwissenschaften, Bioinformatik oder vergleichbar)

in Vollzeit (derzeit 39 Stunden/Woche) zur Mitarbeit im ANR-DFG-Verbundprojekt „Pangenomanalyse der Buche zur Aufklärung der Rolle struktureller genetischer Variation bei der lokalen Anpassung und der Ausprägung adaptiver Merkmale unter verschiedenen Umweltbedingungen“

In dem Projekt sollen die Rolle struktureller genetischer Variation bei der adaptiven Differenzierung der Buche (Fagus sylvatica) und die Effekte von Genotyp-Umwelt Interaktionen in zwei parallelen Versuchsflächen in Frankreich und Deutschland untersucht werden. Dazu soll ein Graph-basiertes Pangenom der Buche mit genetisch diversen Individuen aus verschiedenen geographischen Regionen des Verbreitungsgebiets generiert werden und mit Resequenzierungsdaten, Phänotypen und Umweltvariablen von je mehr als 1000 Individuen pro Versuchsfläche integriert werden. Dies soll unser Wissen über die genetischen Grundlagen lokaler Anpassung bei der Buche erweitern und Vorhersagen über die zukünftige Stabilität von Buchenwäldern verbessern.

Ihre Aufgaben:

• Analyse und Assemblierung von Long-Read Sequenzierungsdaten, speziell PacBio HiFi und ONT UL
• Generierung eines Graph-basierten Pangenoms
• Integration großer Illumina Resequenzierungsdatensätze mit dem Pangenomgraphen
• (Pan-)Genomweite Assoziationsstudien (GWAS) und Genotyp-Umwelt Assoziationsanalysen (GEAs) durch Integration der genomischen Daten mit Phänotypen und Umweltvariablen
• Organisation, Koordinierung und Durchführung von Probennahmen auf Versuchsflächen für die Extraktion von hochmolekularer DNA
• Analyse, Visualisierung und Interpretation von Daten
• Publikation und Präsentation von Ergebnissen
• aktive Weiterentwicklung und Mitgestaltung des Forschungsprojektes

Ihr Anforderungsprofil:

• abgeschlossenes Studium (Univ.-Diplom/M.Sc.) der Biologie, Forstwissenschaften, Bioinformatik, oder angrenzender Disziplinen
• mehrjährige praktische Erfahrung mit der bioinformatischen Analyse von großen genomischen Sequenz-Datensätzen, vorzugsweise im Rahmen einer Doktorarbeit
• Begeisterung für die Wissenschaft und Spaß an wissenschaftlichen Diskussionen
• sehr gute Englischkenntnisse
• Bereitschaft zu mehrtägigen Dienstreisen
• umfangreiche Erfahrung in der Verwendung von High-Performance Computerclustern
• ausgezeichnete Datenanalyse-Fähigkeiten, insbesondere innerhalb von Linux Computersystemen und mit R

Das Arbeitsverhältnis richtet sich nach den Bestimmungen des Tarifvertrags für den öffentlichen Dienst (TVöD); die Zahlung des Entgelts erfolgt bei Erfüllung der tariflichen und persönlichen Voraussetzungen nach Entgeltgruppe 13 TVöD.

Wir unterstützen die Vereinbarkeit von Beruf und Familie und sind Träger des Zertifikates audit berufundfamilie. Um die Vereinbarkeit zu unterstützen, bietet das Thünen-Institut im Rahmen der dienstlichen Möglichkeiten u.a. flexible Arbeitszeitmodelle, Homeoffice und Telearbeit an. Teilzeitbeschäftigung ist grundsätzlich möglich.

Das Thünen-Institut fördert die berufliche Gleichstellung von Frauen und Männern und begrüßt daher ausdrücklich die Bewerbung von Frauen.

Wir leben ein diverses und weltoffenes Miteinander. Das Johann Heinrich von Thünen-Institut verpflichtet sich zur Inklusion. Bewerbungen von Menschen mit Schwerbehinderung sind daher ausdrücklich erwünscht. Diese werden im Auswahlverfahren bevorzug berücksichtigt. Bitte fügen Sie Ihrer Bewerbung einen Nachweis über die Schwerbehinderung oder Gleichstellung bei.

Bei Fragen kontaktieren Sie bitte Niels Müller (+49-4102-696108, niels.mueller@thuenen.de).

Ihre Bewerbung mit Motivationsschreiben, Lebenslauf, relevanten Zeugnissen sowie Empfehlungsschreiben schicken Sie bitte möglichst per E-Mail als eine pdf-Datei mit dem Betreff „2024-278-FG“ bis zum 05.01.2025 an

fg@thuenen.de

Johann Heinrich von Thünen-Institut

Institut für Forstgenetik

Sieker Landstr. 2, 22927 Großhansdorf

Informationen nach Artikel 13 DSGVO zur Erhebung personenbezogener Daten finden Sie unter www.thuenen.de/datenschutzhinweis-bewerbungen.