Institut für
FG Forstgenetik
Projekt
Pappel Diözie
Aufklärung der genetischen Grundlagen und der molekularen Mechanismen von Diözie in Pappeln
Diözie (Zweihäusigkeit) und die damit einhergehenden Geschlechtschromosomen können eine bedeutende Rolle für die Biologie und die Züchtung einer Art spielen. Wir möchten die Genetik und die Evolution der Geschlechtschromosomen von Pappeln aufklären, um übergeordnete Fragen bezüglich der Paarungssysteme von Pflanzen zu beantworten.
Hintergrund und Zielsetzung
Diözie, also die Trennung weiblicher und männlicher Blüten auf verschiedene Individuen, ist hunderte wenn nicht tausende von Malen evolutionär unabhängig voneinander entstanden. Die zugrunde liegende Genetik ist allerdings nur ansatzweise entschlüsselt. Das bedeutendste theoretische Model zur Evolution von Diözie geht von zwei genetisch gekoppelten Mutationen aus, einer mit Einfluss auf die Entwicklung der männlichen Staubblätter, und einer mit Einfluss auf die Entwicklung der weiblichen Fruchtblätter (Charlesworth & Charlesworth, 1978). Eine interessante Alternativhypothese ist ein schalterartiger Ein-Gen-Mechanismus (Renner, 2016). Ein solcher Ein-Gen-Mechanismus ließ sich allerding bisher experimentell nicht eindeutig nachweisen.
In diesem Projekt möchten wir natürliche genetische Variation von Pappeln nutzen, um die genetischen Grundlagen und die Evolution eines sehr alten aber dennoch hoch dynamischen Systems der Geschlechtsdeterminierung aufzuklären. Wir möchten verstehen welchen Einfluss die Geschlechtschromosomen auf die genetische Rekombination (Crossing-over) haben, welche Gene bzw. Genvarianten auf den Geschlechtschromosomen ‚gefangen‘ sind und welche sekundären Effekte durch die Diözie möglicherweise verursacht werden. Außerdem möchten wir die Existenz eines möglichen Ein-Gen-Mechanismus in Pappeln experimentell überprüfen. Die Ergebnisse sind sowohl wissenschaftlich als auch praktisch von großem Interesse.
Vorgehensweise
Bei unserer Forschung werden wir genetische, genomische und biotechnologische Methoden kombinieren. Mit Hilfe klassischer Kreuzungen und deren Nachkommen möchten wir die Geschlechts-determinierenden Regionen von Weiß- und Zitterpappeln präzise lokalisieren. Außerdem möchten wir Rekombinationshäufigkeiten entlang dieser Regionen bestimmen. Genom-Sequenzen verschiedener Pappelindividuen ermöglichen anschließend einen detaillierten Blick in die Gene und Sequenzmotive der Geschlechtschromosomen. Dazu greifen wir auf bereits vorhandene, öffentlich zugängliche Genom-Sequenzen zurück, generieren aber auch selbst Genominformationen. Hierfür verwenden wir unter anderem neueste Sequenziertechnologien (z.B. MinION). Schließlich machen wir uns biotechnologische Methoden, wie die gezielte Geneditierung mittels CRISPR/Cas9, zunutze, um unsere Hypothesen experimentell zu überprüfen. Die Pappel bietet dank ihrer genetischen, genomischen und biotechnologischen Ressourcen einzigartige Möglichkeiten, und stellt damit den idealen Modellorganismus für dieses Forschungsprojekt dar.
Thünen-Ansprechperson
Thünen-Beteiligte
Geldgeber
-
Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG)
(national, öffentlich)
Zeitraum
10.2018 - 6.2022
Weitere Projektdaten
Projektstatus:
abgeschlossen
Publikationen zum Projekt
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Shi T-L, Jia K-H, Bao Y-T, Nie S, Tian X-C, Yan X-M, Chen Z-Y, Li Z-C, Zhao S-W, Ma H-Y, Zhao Y, Li X, Zhang R-G, Guo J, Zhao W, El-Kassaby YA, Müller NA, Van de Peer Y, Wang X-R, Street NR, et al (2024) High-quality genome assembly enables prediction of allele-specific gene expression in hybrid poplar. Plant Physiol 195(1):652-670, DOI:10.1093/plphys/kiae078
- 1
Leite Montalvao AP, Kersten B, Kim G, Fladung M, Müller NA (2022) ARR17 controls dioecy in Populus by repressing B-class MADS-box gene expression. Philos Trans Royal Soc B 377(1850):20210217, DOI:10.1098/rstb.2021.0217
- 2
Renner SS, Müller NA (2022) Sex determination and sex chromosome evolution in land plants. Philos Trans Royal Soc B 377(1850):20210210, DOI:10.1098/rstb.2021.0210
- 3
Renner SS, Müller NA (2021) Plant sex chromosomes defy evolutionary models of expanding recombination suppression and genetic degeneration. Nat Plants 7:392-402, DOI:10.1038/s41477-021-00884-3
- 4
Leite Montalvao AP, Kersten B, Fladung M, Müller NA (2021) The diversity and dynamics of sex determination in dioecious plants. Front Plant Sci 11:580488, DOI:10.3389/fpls.2020.580488
- 5
Kim G, Leite Montalvao AP, Kersten B, Fladung M, Müller NA (2021) The genetic basis of sex determination in Populus provides molecular markers across the genus and indicates convergent evolution. Silvae Genetica 70(1):145-155, DOI:10.2478/sg-2021-0012
- 6
Vekemans X, Castric V, Hipperson H, Müller NA, Westerdahl H, Cronk Q (2021) Whole-genome sequencing and genome regions of special interest: Lessons from major histocompatibility complex, sex determination, and plant self-incompatibility. Mol Ecol 30(23):6072-6086, DOI:10.1111/mec.16020
- 7
Müller NA, Kersten B, Leite Montalvao AP, Mähler N, Bernhardsson C, Bräutigam K, Carracedo Lorenzo Z, Hönicka H, Kumar V, Mader M, Pakull B, Robinson KM, Sabatti M, Vettori C, Ingvarsson PK, Cronk Q, Street NR, Fladung M (2020) A single gene underlies the dynamic evolution of poplar sex determination. Nat Plants 6:630-637, DOI:10.1038/s41477-020-0672-9
- 8
Cronk Q, Müller NA (2020) Default sex and single gene sex determination in dioecious plants. Front Plant Sci 11:1162, DOI:10.3389/fpls.2020.01162